應用亞馬遜FBA的主要弊端之一就是費用高。它需要核算到賣家的利潤占比中，會減少賣家的利潤。因此，對于哪些體積小、重量輕的物品，FBA更可行。除此之外，賣家還必需思考庫存倉儲費。這些是賣家向亞馬遜支付的用于將產品存儲在其運營中心的費用。這取決于寄存物品的時間以及產品的尺碼。亞馬遜將不同類別的產品存儲在同一個地方，因此不同品牌的產品會混淆。如果標簽不正確，產品可能會被錯誤處置，甚至可能導致破壞。

選擇亞馬遜物流的賣家必需嚴厲遵照亞馬遜規定的包裝要求。如果不這樣做，可能會導致產品根本無法運送給客戶，這樣就使得包裝沒有靈巧性。因此，依照上述標準預備產品可能是一個煩瑣目耗時的流程。亞馬遜FBA還附帶某些因州而異的稅收責任。作為賣家，了解納稅責任至關重要。

FBA是否適合賣家，賣家可以應用FBA盤算器盤算產品的盈利才能后明確。該盤算器可以讓賣家很好地了解利潤率，并幫助賣家相應地制訂選品商業計劃。

商家配送通常也稱為商家配送網絡（MFN，merchantfulfimentnetwork），是FBA的最佳替代計劃，也就是FBM。賣家負責自行處置和運送訂單。除此之外，賣家還必需提供客戶服務并在涌現問題時處置退貨和退款。

這種方法的所有責任都落在賣家的身上，因此賣家必需有一個具體的系統來確保業務順利進行。在思考選擇亞馬遜，FBM之前，賣家最好滿足以下要求。首先賣家要有個整齊而系統地存儲庫存的地方，其次有可靠的物流和配送網絡，確保產品順利準時送達。最后賣家還應具備迅速處置訂單的才能。這涉及依照標準對訂單進行包裝和貼標簽，同時可以便利地處置退貨、退款并為產品提供客戶服務，而不會對業務發生負面影響。獨家產品和小批量或一次性產品的賣家適合應用FBM。

賣家還需要知曉AmazonSFP（AmazonsellerfulfilledPrime），它與FBM非常相似，商家全權負責處置訂單并將其及時運送給客戶。然而，這有一個很大的優勢，賣家可以在自己完成的列表上展現Prime徽章，并享受所有相關的優勢，而無須注冊FBA。AmazonSFP還允許賣家更有效地擁有BuyBox。在這種情形下，AmazonSFP與FBA相似。在許多方面，AmazonSFP是一個游戲規則的轉變者，因為它允許及格的賣家獲得Prime徽章，而無須支付高額的FBA費用。但是，參加AmazonSFP并不容易。